Riffyn：科研數據記錄工具測評
許多學科領域的研究都涉及大量的數據收集、存檔和分析。雖然過去十年中我們在研究的方式方法上已經取得了巨大的進步，但還有很多研究人員依然依賴人工手段進行數據采集和記錄。從研究生到資深教授，不論研究資歷，都有人事無巨細地把研究手寫進他們實驗室的筆記本里。
舉例來說，一個簡單的生物學實驗可以分為四個部分：
- 設計實驗
- 建立實驗方案
- 收集數據
- 分析數據
雖然整個過程聽起來理所當然、十分流暢，但實際操作起來常會遇到一些問題。多數研究人員會在紙上完成前兩步，偶爾會有人用電子存檔。接下來，他們會先用一個軟件收集數據，再用另一個軟件進行分析。為了讓研究更有深度，研究人員會在研究中設計幾組不同的實驗，而每組實驗對應的數據通常會被單獨記錄存檔。管理一組正在進行的實驗數據也許并沒有什么難度，但實驗結束后要想試圖在多組碎片化的數據中理清關系就顯得很棘手。而當你或你的導師想從十年之前的實驗中找到自己想要的數據時，工程大是一方面，信息的準確性又是另一個問題。
盡管計算機和云計算的發展已經很大程度上推進了數字化進程，但對研究人員來說，能提供和“實驗室筆記”等值滿足感的工具還很少。有些研究人員已經開始使用電子實驗筆記，但都還處于實驗前后謄寫記錄的程度，并沒有發揮電子筆記的最大效應。但可以想見，手寫筆記很快會成為一種累贅的適得其反型工具。
Riffyn 來啦！
Riffyn 科學開發環境 (Scientific Development Environment, SDE) 是一個為科學研發搭建的云端營運程序，誕生于 2014 年。作為一個功能強大的整合工具，Riffyn 能集中儲存研究計劃、實驗參數、研究結果等，讓研究者對實驗/研究有全面而整體的把握。和谷歌、iCloud 等云端硬盤不同，Riffyn 不僅能儲存數據，它還根據研究人員的需求優化定制了界面，對研究結果的搜索和分析都十分友好。
Riffyn 具有以下主要功能：
- 設計：用可視化流程來解釋實驗步驟。研究人員可以根據實驗素材和樣本的處理步驟、評估所得參數、規格限制來進行定制化設計。設計細節根據實驗步驟的順序走，而每一步的輸入和輸出都分別由實驗材料的規格及其對應的研究結果來決定。
該工具還允許用戶更改實驗設計和流程，并和其他用戶進行分享、討論。所有變更都會作為獨立的文檔被儲存，團隊成員可以從時間線上清楚地看到研究數據的變化，并評估其對實驗輸出的影響。此外，它還有助于厘清由多組實驗造成的無序，將不同時間點上的數據依次排序記錄。
- 測量：用戶可以通過“測量模式”記錄實驗數據并將其與其他步驟的數據相連 。該功能既允許研究人員輸入樣本屬性，比如緩沖液的類型、摩爾濃度等；又能記錄樣本結果，不管是單個數值，還是多組重復數據。測量結果可以通過手動輸入、上傳文件、從其他數據庫導入等多種方式輸入進 Riffyn。這樣一來，測量模式相當于在監控和整合不同環節的所有實驗數據，它還能此為基礎創建數據圖表。
- 分析：Riffyn 還有強大的數據分析功能。 程序能自動同步各個環節的所有數據，目前支持兩種類型的分析功能。用戶可以選擇相對簡單的可視化數據信息圖，或是由 Riffyn 自己生成的統計圖表。生成圖表的原始數據可以根據用戶需要，從測量模式或設計模式中抓取。用戶還可以自由組合、過濾不同的信息和參數來制圖，這是 Excel 目前都還不支持的功能。這種分析方法也有助于識別異常值。此外，Riffyn 的數據格式非常普適，R、JMP、Spotfire、Tableau 等主流的數據分析軟件都對其兼容。
- 共享：Riffyn 還有一個突出特點，就是包括實驗/程序信息在內的所有數據都能設置瀏覽、操作、編輯、管理等不同的共享權限。
- 連接：Riffyn 對各種電子表格、LIMS、SQL 數據庫、Sharepoint、在線數據和手動輸入數據都能兼容。同時還能自動將對應的數據流程/實驗與導入數據匹配。
簡單來講，可以把 Riffyn 看成是研究的一份電子副本，它集中記錄研究的過程、屬性、實驗和數據，滿足你一站式的分析需求。當數據存檔和分析缺乏準確性，研究也就沒了實際意義。
在今天這個時代，當用復雜的技術生成大量數據已經成為一種常態，也是時候割舍我們對那種原始實驗方式的依賴，啟用一種可靠而客觀的電子工具了。
雖然 Riffyn 對很多領域都適用，但它最適合生物制藥、工業生物技術和食品行業。這也許就是我們一直期待的未來的樣子。盡管 Riffyn 不是免費軟件，但它對所有用戶開放兩周的免費演示賬戶。
想要快速了解 Riffyn 的其他功能，可以參考它官網的演示視頻。
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