問題： 查重應該包含參考文獻嗎？

參考文獻通常不會進行查重，因為這部分的內容通常相似度都很高。參考文獻不包含是確定的，但多少百分比算是重復率過高則沒有一定的規則，每個期刊的標準可能有所不同，也可能根據領域以及內容的性質而有改變。一般來說，根據 2013 年的期刊編輯報告，超過 50% 的重復率算是危險，不過大部分的期刊編輯都會將查重檢查報告當作補充信息，并進行人工檢查。許多期刊也會將材料章節排除，因為這個章節的用語都差不多，也多有重復。

我會建議你排除參考文獻后進行查重，如果重復率超過 30% 的話，就需要仔細檢查。最重要的是，不管有沒有被查重軟件標示出來，只要是引用自其他來源的內容，都應該要確實標注出處。

希望我的回答有用，你還可以參考《意得輯專家視點》上關于抄襲的詳細指南。