美國可重復性項目 (Reproducibility Project) 首次調查發現點出可重復危機

美國可重復性項目 Reproducibility Project: Cancer Biology 發布了他們最先嘗試重復的五個研究的結果報告,報告結果在生物學界造成一股暴風。此次發現發表在《eLife》期刊上,內容提到在這五個研究中,只有兩個能成功重復,一個失敗,而剩下的兩個是“無法闡釋的結果 (uninterpretable results)”。
可重復項目并不是第一個想要重復發表結果的項目。在 2012 年,生物科技公司 Amgen 就發表過一份報告,指出公司的研究人員無法重現 53 個突破性癌癥研究中的 47 個結果。受該行動啟發,Science Exchange 和開放科學中心 (Center for Open Science) 聯手合作推出可重復項目,復制 29 個在 2010 年至 2012 年間在臨床前階段發表的重要癌癥研究。與 Amgen 的項目不同的是,可重復項目的過程和發現都會免費開放。
以下是可重復項目的重復研究細節:
- 在五個研究中,成功重復的兩個研究為:斯坦福大學計算生物學家 Atul Butte 領導的 Discovery and preclinical validation of drug indications using compendia of public gene expression data 以及Constantine Mitsiades 在丹娜法伯癌癥研究院(Dana-Farber Cancer Institute) 期間帶領的 BET Bromodomain inhibition as?a therapeutic strategy to target c-Myc。
- 無法闡釋的研究為丹娜法伯癌癥研究院 Petar Stojanov 領軍的 Melanoma genome sequencing reveals frequent?PREX2?mutations 和斯坦福干細胞生物學家 Irving Weissman 的 The CD47-signal regulatory protein alpha (SIRPa) interaction is a therapeutic target for human solid tumors。
- 唯一無法重復的研究是加利福尼亞桑福德-伯納姆-普利貝斯醫學探索研究所 (Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, SBP) 癌癥生物學家 Erkki Ruoslahti 主導的 Coadministration of a tumor-penetrating peptide enhances the efficacy of cancer drugs。
許多科研人員,特別是生物學家,對這個項目表示支持,因為項目曝光了發表文獻缺少的研究方法細節,鼓勵科研人員不要輕信表面上的結果。
不過,也有人指出重復生物研究是非常困難的,因為其中牽涉的復雜程度有好幾層,因此他們建議不要將無法復制的研究當成最終裁決。加利福尼亞 Palo Alto 斯坦福大學的流行病學家 John Ioannidis 總結了這個項目發現:「綜合來看,是有重復問題。」
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參考資料