表達基因和基因產物的格式技巧

表達基因和基因產物的格式技巧

有些格式風格簡單直接,有些則需要理解相關主題,這里要討論的基因和基因產物就是一例。「以斜字體表示品種的學名」﹑「以斜字體表示基因符號」都是很簡單的指示,但基因命名不只如此,本文不探討這些簡單的部分,而是著重在復雜之處。

其中一個復雜點是不同的生物各有不同的風格格式標準,比如人類基因的命名是按照國際人類細胞學術語命名法,而大部分品種的化學式,第一個大寫字母代表顯性基因,之后的小寫字母代表隱性基因。Hs 代表毛鞘,玉米的顯性基因,?注意第一個字母是大寫斜體?;sh 是萎縮的胚乳,一個隱形癥狀,注意字母是小寫,以上兩個例子同時也反映出化學式的起始字母不一定代表特定的字詞。

再回到生物群組間不同的使用習慣:酵母菌的基因符號都是由三個斜體字母組成,顯性基因大寫,隱性基因小寫,所以 MAL?代表發酵麥芽糖(fermenting maltose)的基因,gal?代表發酵半乳糖(fermenting galactose)的基因,酵母菌屬真菌類,但其他組的真菌基因則不適用這個慣用規則。

還有基因座 loci,locus 的復數,表示同個基因的不同位置或地方,等位基因 alleles 則是表示在特定的染色體處于相同位置的基因,但異變后在同一特征具有不同版本,基因座的化學式是基因符號加上標的斜體阿拉伯數字,等位基因的化學式則由上標的小寫字母加符號。

基因符號一般是斜體的,其產物則以正常非斜體羅馬字母表示:HD?代表(人類)基因的huntingtin基因(一種蛋白質)或亨延頓病基因,而 HD 代表亨延頓病。

到這里,基因和蛋白命名之復雜顯而易見,不遵循單一簡單的規則。

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