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給科研新手的數字工具指南:項目管理和數據共享工具

隨著學術格局的不斷發展,現在科研人員可以使用許多不同的工具來管理其各個方面和階段的工作流程和溝通。在上一篇文章中,我已經總結了一些文獻檢索和文獻管理工具。本文我將介紹一些項目管理和數據共享工具,這兩個方面對研究和發表同樣重要。
項目管理工具
研究項目需要大量的管理、團隊合作和規劃工作。對科研人員來說,日常工作一般包括做實驗、收集和分析數據、與同事討論等。項目管理工具可幫助研究者高效計劃和管理日常任務,以下項目管理工具是專門針對學術研究者而設計的:
Labguru:這是一個電子實驗室筆記本 (electronic laboratory notebook , ELN),提供協作式項目規劃和文件存儲。科研人員可以利用 ELN 設計實驗和工作流程,抓取結構化和非結構化數據,管理項目,并從直觀的用戶界面直接分享他們的工作,讓監測研究進展更加輕松。該工具還設有一些有趣的功能,包括可定制的實驗模板,冷藏箱中試劑的庫存,跟蹤細胞系,實驗動物、細菌、標本等,協議集成,和標準作業程序 (SOP)。
Asana:Asana 是一個基于網絡的移動項目管理應用,可以促進團隊溝通和協作,從而消除了電子郵件交流的必要。Asana 可以用來創建項目和任務,并且可以在各種瀏覽器和設備跟蹤任務進度。此工具的功能包括筆記分享、多種格式附件的上傳、任務組織、實時更新、活動更新、通知和提醒。Asana 不僅允許用戶全程跟蹤他們的項目,而且還會生成詳細的進度報告。
Gantt Charts:一種常見且有用的項目管理工具是甘特圖。這不是應用程序,而是一種以連續和并行任務的形式顯示項目計劃的方式。在甘特圖中,橫軸方向表示時間,縱軸方向表示任務,因此,橫條長度表示任務的持續時間,而圖上的位置表示時間點。甘特圖可在 Word 表格或 Excel 表中輕松生成,但使用 Microsoft Project 或 Wrike 等定制軟件生成的甘特圖的功能會更強大。對于科研人員來說,這一工具可跟蹤重疊并行項目,為順利推進多個項目進行規劃和安排。
sciNote:這是一款帶有工作流程和模塊化功能的開源實驗室筆記本。sciNote 的一個有趣功能是它允許用戶在工作流程中鏈接項目的不同階段,從而將項目或實驗不同階段獲得的數據連接起來,擴展了數據背景;此功能使實驗室筆記本條目的邏輯進程變得清晰。這款軟件還有一項有趣功能是每個用戶都有自己的角色并享有團隊內一系列權限,以保護每位研究人員的個人數據并確保其機密性。
數據共享工具
數據對研究者至關重要,但分析、存儲和共享大型數據集是一項艱巨的任務。目前已經開發了一些工具來幫助研究者完成這些任務,這些數據管理工具通常有助于數據分析,也是存儲和共享數據的有效方式。由于數據共享是現在大多數資助機構的要求,這些工具也變得越來越重要。
Zenodo:Zenodo 是一個多學科研究產品儲存庫,支持各種內容,包括刊物、演示文稿、論文集、項目、圖像、軟件(包括與 GitHub 的集成)以及所有語言的數據,由歐洲核子研究組織 (European Organization for Nuclear Research, CERN) 維護。它對數據格式沒有任何限制,最多可以存儲 50GB 的數據。此儲存庫中數據可終身保存,可以采用封閉(只要未授權都無法訪問)、開放或禁止(禁止期內無法訪問)狀態儲存。
DataCite:DataCite 為研究數據提供 DOI 號。它收集每個有 DOI 的元數據,結合成大型索引研究數據,這些數據可直接查詢,讓人查找數據和其他研究物件,正確引用數據,獲取統計數據并探索連接。所有元數據都可自由訪問和查看。DataCite 提供了一個集成的搜索界面,可以從數百萬條記錄中搜索、篩選和提取所有細節。該軟件可用于跟蹤與基金相關的數據,這點很重要,因為資助機構要求數據共享。此外,跟蹤經費數據可以讓資助機構更好地了解他們的資金所產生的影響。
Dryad:Dryad 是一個科學和醫學論文數據儲存庫,讓科研論文的數據可被發現,可自由重復使用和可引用。Dryad 可存儲表格、電子表格、文本、視頻、照片、軟件代碼和其他無儲存庫可保存的發表數據。Dryad 支持許多期刊的整合提交功能,因此當作者將數據與其發表的文章一起提交給 Dryad 時,數據的鏈接也會包含在發表的文章中。Dyrad 的目標用戶是研究人員、期刊、科研協會、出版商、研究單位、圖書館和資助機構,因此具有廣泛的知名度,并且數據庫資源豐富。
Figshare:Fighare 是一個基于云計算網絡的在線數字資源庫,科研人員可以保存和分享他們的研究成果,包括數據、數據集、圖像、視頻、海報和代碼,從而使得他們的研究,甚至包括初步研究,曝光并獲得認可。由于 Fighare 遵循開放數據原則,用戶可以自由訪問數據和上傳內容。因此,科研人員可以通過 Fighare 公開他們的數據,Fighare 上的所有條目都有 DOI,方便引用。Fighare 還跟蹤托管材料的下載統計,做為 altmetrics 的來源。
你使用過這些工具嗎?是否發現有其他好用的工具?如果有,歡迎在下面的留言分享你的使用經驗。相信你的觀點會對很多研究人員帶來幫助。
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